eclipse すべてのブレークポイントをスキップ機能を行いたいのですね。下記を見てください。

Java – 別プロジェクトのクラスを使いたい|teratail
https://teratail.com/questions/8623

Java – Eclipseで別のプロジェクトを参照する方法|teratail
https://teratail.com/questions/72

Eclipse 他のプロジェクトを参照する/プロジェクトを閉じる・開く方法 | ITSakura
https://itsakura.com/eclipse_projectreference

javaのプログラムが人に読まれたり、変更されるのが怖いのでしょう。

その道のプロのなり損ないでも、VBAに救われた技術者はきっと多いのだろうと思います。

javaは比較的簡単ですから。既存のアルゴリズムも簡単に実装できますし。

今後はどこでもjavaを使える人が多くなって、他人にコードを見られたくないなとか思うようになってくるかもしれません。